Установи зобов’язані привести спеціальний фонд кошторису у відповідність до надходжень згідно із постановою КМУ «Про затвердження Порядку складання, розгляду, затвердження та основних вимог до виконання кошторисів бюджетних установ» від 28.02.2002 № 228
Якщо фактичний обсяг власних надходжень бюджетних установ з урахуванням залишків на початок року менший, ніж плановані показники, враховані у спеціальному фонді кошторису, розпорядники зобов’язані за три тижні до кінця бюджетного періоду внести зміни до кошторису та зведення показників спеціального фонду кошторису. Тобто установи мають зменшити надходження і видатки, враховуючи очікуване виконання спеціального фонду кошторису у відповідному бюджетному періоді.
Після цього установам потрібно упорядкувати бюджетні зобов’язання з урахуванням внесених до спеціального фонду кошторису змін.